Speciális szétválasztási projektekben a vízkezelő membrántechnológiát elsősorban anyagkoncentrációra, festékes szennyvízkezelésre és fehérjeleválasztásra használják a biogyógyszerekben. A nanoszűrő membrán és az elektrodialízis technológiák szerepet játszanak a szelektív elválasztásban ezeken a területeken, mint például a nanoszűrés a molekulatömeg-különbséggel rendelkező anyagok elválasztására, illetve az elektrodialízis a sav és lúg visszanyerésére. A biogyógyászati ​​készítményekben a downstream tisztításhoz ultraszűrésre és mikroszűrésre van szükség a vírusok vagy sejttörmelékek eltávolítására a termék tisztaságának és biztonságának biztosítása érdekében.